Les évaluations menées par la CEPP comportent trois phases principales:
1) l'esquisse de projet
2) l'étude de faisabilité
3) la réalisation de l'évaluation.
Les principaux outils utilisés sont les entretiens approfondis avec les personnes concernées ou visées, les auditions de fonctionnaires, les entretiens de groupes, les sondages, les comparaisons intercantonales ainsi que les analyses de documents administratifs, de statistiques et d'ouvrages de référence.
